Les complications classiques de la sleeve gastrectomy par cœlioscopie incluent elles aussi des fistules anastomotiques, des occlusions digestives, des hémorragies … Pendant l’intervention, il existe un risque de conversion (nécessité de devoir ouvrir plus grand la cavité abdominale). En période post-opératoire, il existe un risque de devoir réopérer le patient, éventuellement en urgence, en cas de mauvaise évolution (fièvre, douleur, choc…). Une complication propre à la Sleeve est le risque de gastroplégie (paralysie de l’estomac) avec vomissements qui cède généralement spontanément au bout de quelques jours. Le risque de fistule post-opératoire (principalement sur la rangée d’agrafes de la gastrectomie) est de 2 %. Ce risque est plus important (5%) si le patient a déjà eu un anneau ou une autre chirurgie de l'obésité comme l'agrafage de Mason dans le passé. Le temps de cicatrisation de ces fistules varie de quelques jours à plusieurs mois... Dans ce cas, une ré-intervention ou plus sont parfois nécessaires éventuellement complétées par la pose d’endoprothéses (petits tuyaux positionnés dans l'estomac) mis en place par la bouche par des gastro-entérologues afin d'accélérer la cicatrisation. En parallèle, toute alimentation est supprimée par la bouche; le patient étant nourri par les veines. Chose moins agréable, il peut également être laissé en place une sonde gastrique par le nez et ce jusqu'à cicatrisation complète.